STARmap&MERFISH Maus-Zell-Gen-Paar-Datensatz

Dieser Datensatz stammt aus dem PapierEntdeckung von Gewebemodulen in räumlichen Transkriptomikdaten mit Einzelzellauflösung durch zellinteraktionsbewusste Zelleinbettung", zwei der verwendeten Mauszell-Genpaar-Datensätze: der MERFISH-Mausdatensatz und der STARmap-Mausdatensatz.

In dieser Studie wurden zwei Datensätze vorverarbeitet:

• Für den STARmap-Maus-PLA-Datensatz wurde die normalisierte Zell-Gen-Matrix durch das Originalpapier bereitgestellt und log-transformiert.

• Für den MERFISH-Maus-AB-Datensatz wurde die Genzählmatrix aus der CELL x GENE-Bibliothek bezogen. Die Gesamtzahlen pro Zelle wurden auf 10.000 normalisiert und die normalisierte Zell-Gen-Matrix wurde log-transformiert.