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STARmap&MERFISH Maus-Zell-Gen-Paar-Datensatz
Datum
vor einem Jahr
Größe
22.9 GB
Veröffentlichungs-URL
Paper-URL
Dieser Datensatz stammt aus dem PapierEntdeckung von Gewebemodulen in räumlichen Transkriptomikdaten mit Einzelzellauflösung durch zellinteraktionsbewusste Zelleinbettung", zwei der verwendeten Mauszell-Genpaar-Datensätze: der MERFISH-Mausdatensatz und der STARmap-Mausdatensatz.
In dieser Studie wurden zwei Datensätze vorverarbeitet:
- Für den STARmap-Maus-PLA-Datensatz wurde die normalisierte Zell-Gen-Matrix durch das Originalpapier bereitgestellt und log-transformiert.
- Für den MERFISH-Maus-AB-Datensatz wurde die Genzählmatrix aus der CELL x GENE-Bibliothek bezogen. Die Gesamtzahlen pro Zelle wurden auf 10.000 normalisiert und die normalisierte Zell-Gen-Matrix wurde log-transformiert.
STARmap+MERFISH.torrent
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