HyperAI超神経

APMタンパク質生成データセット

日付

11日前

サイズ

9.06 GB

組織

中国科学院 (中国科学院)

公開URL

zenodo.org

ライセンス

其他

カテゴリ

このデータセットは、湖南大学、中国科学院大学、ByteDance Seed Teamによって2025年に公開されたタンパク質生成データセットです。関連する論文の結果は「タンパク質複合体の設計のための全原子生成モデル”。

データセットの構成

  • 単鎖タンパク質データセット: PDB (18,684)、Swiss-Prot (140,769)、AFDB (28,041) データベースから、さまざまなタンパク質タイプと機能を網羅する 187,494 のサンプルが含まれています。
  • マルチチェーンタンパク質データセット:2~6鎖タンパク質複合体を網羅する11,620サンプルを含み、マルチチェーンモデリングをサポートします。データはPDB生物学的アセンブリデータから取得され、SAbDab抗体データベースに含まれるサンプル、長さが30未満の鎖(ペプチドとみなされる)を含むサンプル、長さが2,048を超えるサンプル、またはクラスターIDを持たないサンプルの3種類のサンプルは除外されています。研究者らはトレーニング中にマルチチェーンサンプルをランダムにトリミングしました。384残基を超えるサンプルは、鎖間結合界面残基ペアを中心に配置し、最も近い384アミノ酸を保持しました。

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