STARmap&MERFISH マウス細胞遺伝子ペア データセット

このデータセットは論文です。細胞間相互作用を認識した細胞埋め込みによる、単一細胞解像度の空間トランスクリプトミクスデータにおける組織モジュールの発見」では、MERFISH マウス データ セットと STARmap マウス データ セットの 2 つのマウス細胞遺伝子ペア データ セットが使用されました。

この調査では、2 つのデータセットに対して前処理が実行されました。

• STARmap マウス PLA データセットの場合、正規化された細胞遺伝子マトリックスが元の論文から提供され、対数変換されました。

• MERFISH マウス AB データセットの場合、遺伝子数行列は CELL x GENE ライブラリから取得されました。細胞あたりの総数は 10,000 に正規化され、正規化された細胞遺伝子行列が対数変換されました。