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STARmap&MERFISH マウス細胞遺伝子ペア データセット

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このデータセットは論文です。細胞間相互作用を認識した細胞埋め込みによる、単一細胞解像度の空間トランスクリプトミクスデータにおける組織モジュールの発見」では、MERFISH マウス データ セットと STARmap マウス データ セットの 2 つのマウス細胞遺伝子ペア データ セットが使用されました。

この調査では、2 つのデータセットに対して前処理が実行されました。

  • STARmap マウス PLA データセットの場合、正規化された細胞遺伝子マトリックスが元の論文から提供され、対数変換されました。
  • MERFISH マウス AB データセットの場合、遺伝子数行列は CELL x GENE ライブラリから取得されました。細胞あたりの総数は 10,000 に正規化され、正規化された細胞遺伝子行列が対数変換されました。
STARmap+MERFISH.torrent
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