このデータセットには、7,930個の単一細胞からのトランスクリプトーム発現データが含まれており、3つの異なる生物学的状態（健常免疫ベースライン、液性腫瘍（骨髄性白血病）、固形腫瘍微小環境（メラノーマ））を網羅しています。本データセットは、コホート間統合単一細胞解析ベンチマークの構築を目的としており、アルゴリズムの性能評価と方法論の比較、マルチコホートバッチ効果補正、免疫疲弊状態解析、そして腫瘍タイプ間のバイオマーカーマイニングのためのベンチマークを提供します。

データセットの構成:
1. コホートA: 健康な免疫ベースライン（約2,700個の細胞）

• 出典: 10x Genomics PBMC3k
• 生物学的背景: 健康なドナーからの末梢血単核細胞 (PBMC) を免疫恒常性のベースラインコントロールとして使用しました。
• 目的: 腫瘍関連免疫状態の変化を比較する。

2. コホートB：液性腫瘍/骨髄性白血病（約2,730個の細胞）

• 出典：ポール他、2015年
• 生物学的背景：骨髄前駆細胞および白血病関連細胞状態の単一細胞トランスクリプトームデータ
• 機能: 造血悪性腫瘍のモデルを表す

3. コホートC：固形腫瘍微小環境（約2,500個の細胞）

• 出典：腫瘍免疫細胞アトラス（TICAtlas）
• 生物学的背景: 疲弊した T 細胞、マクロファージ、腫瘍細胞など、黒色腫などの固形腫瘍の微小環境に由来する免疫細胞および悪性細胞。
• 用途: 固形腫瘍における免疫抑制および細胞の異質性を研究するために使用されます。