Ensemble De Données De Paires Cellules-gènes De Souris STARmap&MERFISH

Cet ensemble de données provient du documentDécouverte de modules tissulaires dans des données de transcriptomique spatiale à résolution unicellulaire via l'intégration cellulaire tenant compte des interactions cellule-cellule", deux des ensembles de données de paires cellules-gènes de souris utilisés : l'ensemble de données de souris MERFISH et l'ensemble de données de souris STARmap.

Cette étude a prétraité deux ensembles de données :

• Pour l'ensemble de données PLA de souris STARmap, la matrice cellule-gène normalisée a été fournie par l'article original et transformée en logarithme.

• Pour l'ensemble de données AB de la souris MERFISH, la matrice de comptage des gènes a été obtenue à partir de la bibliothèque CELL x GENE. Le nombre total de cellules par cellule a été normalisé à 10 000 et la matrice cellule-gène normalisée a été transformée logarithmiquement.