Cet ensemble de données contient des données d'expression transcriptomique de 7 930 cellules uniques, couvrant trois états biologiques différents : un état immunitaire sain de base, une tumeur liquide (leucémie myéloïde) et un microenvironnement tumoral solide (mélanome). Il vise à établir un référentiel d'analyse unicellulaire intégré et inter-cohortes afin de fournir une base de référence pour l'évaluation des performances des algorithmes et la comparaison méthodologique, la correction des effets de lot inter-cohortes, l'analyse de l'état d'épuisement immunitaire et l'identification de biomarqueurs inter-types de tumeurs.

Composition de l'ensemble de données:
1. Cohorte A : Niveau de référence immunitaire sain (environ 2 700 cellules)

• Source : 10x Genomics PBMC3k
• Contexte biologique : Les cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) de donneurs sains ont été utilisées comme contrôle de base pour l'homéostasie immunitaire.
• Objectif : Comparer les changements de l'état immunitaire associé à la tumeur.

2. Cohorte B : Tumeur liquide/leucémie myéloïde (environ 2 730 cellules)

• Source : Paul et al., 2015
• Contexte biologique : Données transcriptomiques unicellulaires de cellules progénitrices myéloïdes et d’états cellulaires liés à la leucémie
• Fonction : Représente un modèle de tumeurs malignes hématologiques

3. Cohorte C : Microenvironnement tumoral solide (environ 2 500 cellules)

• Source : Atlas des cellules immunitaires tumorales (TICAtlas)
• Contexte biologique : Cellules immunitaires et cellules malignes provenant du microenvironnement des tumeurs solides telles que le mélanome, notamment les lymphocytes T épuisés, les macrophages et les cellules tumorales.
• Application : Utilisé pour étudier l'immunosuppression et l'hétérogénéité cellulaire dans les tumeurs solides.