مجموعة بيانات التنبؤ بالبنية المعقدة الديناميكية لبروتين DynamicBind

هذه المجموعة من البيانات من الورقةDynamicBind: التنبؤ ببنية مجمع البروتين-الربيطة الخاص بالربيطة باستخدام نموذج توليدي متغاير عميقاستُخدمت مجموعات التدريب والاختبار لمجموعة بيانات AlphaFold للتنبؤ بالالتحام الديناميكي للبروتينات. نُشرت هذه الورقة البحثية من قِبل مجموعة تشنغ شوانغجيا البحثية في جامعة شنغهاي جياو تونغ، بالتعاون مع شركة StarPharmaceuticals، وكلية الصيدلة بجامعة صن يات صن، وجامعة رايس في الولايات المتحدة. اقترح فريق البحث نموذجًا هندسيًا توليديًا عميقًا DynamicBind مُصممًا للالتحام الديناميكي للبروتينات، والذي يُمكنه تعديل تكوين البروتين بفعالية من التنبؤ الأولي بـ AlphaFold إلى حالة شبيهة بالتصوير المجسم، مما يُوفر نموذجًا بحثيًا جديدًا قائمًا على التعلم العميق، يأخذ في الاعتبار التغيرات الديناميكية للبروتينات لتطوير الأدوية في مرحلة ما بعد AlphaFold.

البيانات الأصلية المستخدمة في الورقة تأتي من مجموعة بيانات عامة PDbbind2020البيانات البحثية وبيانات التدريب المعالجة الناتجة عن هذه الدراسة متاحة للتنزيل على هذه الصفحة.