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VenusMutHub タンパク質変異小規模サンプルデータセット
※本データセットはオンライン利用に対応しておりますが、ここをクリックしてジャンプしてください。
VenusMutHubは、上海交通大学のHong Liang教授のチームが2025年に発表したタンパク質変異工学AIモデルを評価するための新しいベンチマークです。関連する論文の結果は次のとおりです。VenusMutHub: 小規模実験データにおけるタンパク質変異効果予測因子の体系的評価「この研究は、Acta Pharmaceutica Sinica B誌に掲載されました。」
VenusMutHub は、実際の応用シナリオ向けのタンパク質変異の小規模サンプルデータセットとしては初となるものです。研究チームは、実際の応用シナリオ向けに 905 件の小規模サンプル実験変異データセットを慎重に編集し、527 個のタンパク質 (うち 981 個の TP3T タンパク質には 5 ~ 200 件の変異があります) をカバーし、安定性、活性、結合親和性、選択性など、さまざまな機能測定データをカバーしています。すべてのデータは、代替の蛍光読み取りではなく直接的な生化学測定を使用して取得され、評価の正確性が保証されています。
さらに、研究チームは、タンパク質配列、3次元構造、進化情報などを活用したさまざまな手法を網羅した23の最先端の計算モデル(AIモデルと非AIモデル)をテストし、実際の応用シナリオにおける小規模なサンプルデータに対するこれらのモデルの予測能力を総合的に評価しました。
オープンリソースであるVenusMutHubは今後も更新され続ける予定です(https://lianglab.sjtu.edu.cn/muthub/)、この分野で信頼できるベンチマークを提供し、タンパク質機能予測をより標準化し、より迅速な開発に向けて推進します。