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PepPrCLIPデータセット
データは論文から得たものである対照言語モデリングによる構造的に多様な標的に対するペプチド結合剤の新規設計「(2025年1月にScience Advancesに掲載)すべての生データと処理済みデータ。」デューク大学の研究チームが発表した論文では、CLIP ベースのペプチド優先スクリーニング プロセス PepPrCLIP が構築されており、このプロセスでは、これまで治療不可能だった病原性タンパク質に結合して破壊する短いタンパク質を設計できます。ターゲットの 3D 構造を使用してペプチドを生成する既存のプラットフォームである RFDiffusion と比較すると、PepPrCLIP はより高速で、ほぼ常にターゲット タンパク質に近いペプチドを作成します。
引用
@misc{bhat_2024_13917484, 著者 = {Bhat、Suhaas、および パレプ、カリヤン、 ホン、ローレン、そして マオ、ジョーイ、そして そうだ、天正と アイヤー、レマ、そして 趙、林、 陳、天来、そして ヴィンコフ、ソフィア、そして ワトソン、リオ、そして 王、田Z.と スリジェイ、ディヴィヤ、そして ヴェンカタ、スリカール・カビラユニ、 コリーナ、クセニア、そして ゴエル、シュレイ、そして ヴレ、プラナイ、そして デスファンデ、アニルッダ J. および ソダーリング、スコット H. および デリサ、マシュー P. および チャタジー、プラナム}、 タイトル = {ペプチド結合剤のデノボ設計 対照的な構造的多様性を持つ標的 言語モデリング }, 年 = 2024、 発行者 = {Zenodo}、 ドイ = {10.5281/zenodo.13917484}、 url = {https://doi.org/10.5281/zenodo.13917484}, }