11 天前

MIMIC-III,一个可免费获取的重症监护数据库

{Roger G. Mark, Leo Anthony Celi, Peter Szolovits, Benjamin Moody, Mohammad Ghassemi, Mengling Feng, Li-wei H. Lehman, Lu Shen, Tom J. Pollard, Alistair E.W. Johnson}
MIMIC-III,一个可免费获取的重症监护数据库
摘要

MIMIC-III(“重症监护医学信息集市”)是一个大型、单一中心的数据库,收录了美国马萨诸塞州波士顿贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)重症监护病房住院患者的相关临床信息。数据内容涵盖生命体征、用药记录、实验室检查结果、医护人员记录的观察数据与病程记录、液体出入量、操作编码、诊断编码、影像学报告、住院时长、生存状态等。该数据库广泛支持学术与工业界研究、医疗质量改进项目以及高等医学教育课程建设。近年来,全球医院系统持续推进电子健康记录(EHR)系统的部署。以美国为例,2008年至2014年这七年间,拥有基础电子化系统的非联邦急性期医疗机构比例从9.4%显著提升至75.5%(参考文献1)。尽管取得上述进展,医疗信息系统之间的互操作性问题仍未能有效解决,导致数据整合面临诸多挑战。因此,医院数据在理解与优化临床照护方面所蕴含的巨大潜力尚未得到充分释放。与此同时,科学界也日益受到研究可重复性不足的批评(参考文献2)。本文报告MIMIC-III数据库的正式发布,该数据库是对广受使用的MIMIC-II数据库(数据引用1)的重要更新。MIMIC-III整合了贝斯以色列女执事医疗中心住院患者的去标识化、全面临床数据,并通过数据使用协议(Data Use Agreement)向全球研究者开放获取(图1)。其开放共享的特性,使得临床研究得以在更高透明度和可复现性基础上开展,为研究的验证、拓展与改进提供了前所未有的可能性。

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