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VenusMutHub 蛋白质突变小样本数据集

日期

8 个月前

大小

1.85 MB

机构

Shanghai Jiao Tong University

许可协议

MIT

* 该数据集支持在线使用,点击此处跳转

VenusMutHub 为上海交通大学洪亮教授团队于 2025 年发布的蛋白质突变工程 AI 模型评测新基准,相关论文成果为「VenusMutHub: A systematic evaluation of protein mutation effect predictors on small-scale experimental data」,该研究已发表在 Acta Pharmaceutica Sinica B 期刊上。

VenusMutHub 是首个针对真实应用场景蛋白质突变小样本数据集,研究团队精心整理了 905 个真实应用场景的小样本实验突变数据集,覆盖 527 种蛋白质(其中 98% 的蛋白的突变数量在 5-200 个之间),涵盖了稳定性、活性、结合亲和力与选择性等多种功能测量数据。所有数据均采用直接生化测量,而非替代性荧光读数,确保了评估的准确性。

此外,团队还测试了 23 种前沿计算模型(AI 和非 AI 模型),涵盖利用蛋白质序列、三维结构与进化信息的多种方法,全面评估了这些模型在真实应用场景小样本数据上预测能力。

作为开放资源,VenusMutHub 将持续更新 (https://lianglab.sjtu.edu.cn/muthub/),为领域提供可靠基准,推动蛋白质功能预测走向更规范,更高速的发展。

VenusMutHub.torrent
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