أمبر (Amber) هو حزمة برمجية لمحاكاة الديناميكا الجزيئية (MD)، تم تصورها لأول مرة من قبل بيتر كولمان وفريقه والباحثين المتعاونين معه بهدف محاكاة الأنظمة البيوموليكولية. يتوفر وحدة pmemd كنسخة تسلسلية للوحدات المعالجة المركزية (CPUs)، بالإضافة إلى نسخ مُعدّة لوحدات معالجة الرسوميات من نوع NVIDIA وAMD، وكذلك نسخ متعددة التوازي باستخدام واجهة تبادل الرسائل (MPI). وتشمل القدرات المتقدمة: التكامل الديناميكي الحراري، وطريقة محاكاة التبادل بين النسخ، وطرق محاكاة الديناميكا الجزيئية المُسرّعة. ويُقدّم هذا الملاحظة التطبيقية نظرة عامة موجزة على التحديثات الأخيرة للبرمجية، بالإضافة إلى القدرات الجديدة التي تم إضافتها مؤخرًا.