JAM-2: التصميم الكامل الحسابي للجسوم المضادة شبه الأدوية ب معدلات نجاح عالية
Nabla Bio

الملخص
نقدم نظام JAM-2، وهو نظام تصميم بروتينات de novo عام الغرض، الذي يُعد لأول مرة قادرًا على إنتاج أجسام مضادة من نوع VHH-Fc والجهاز المناعي الكامل (mAb) بخصائص ارتباط دوائية (drug-like affinities) وقابلية تطوير (developability) متميزة، مع تحقيق معدلات نجاح تصل إلى رقمين في العشرات، وبطيف واسع غير مسبوق من الأهداف والمنطقة المستهدفة (epitopes). على مدى 16 هدفًا لم يُسبق رؤيته، أنتج JAM-2 جزيئات ارتباط (binders) لجميعها بنسبة 100٪، بمعظم معدلات نجاح وصلت إلى 39٪ (لـ VHH-Fc) و18٪ (لـ mAb). وباستخدام فقط 45 تصميمًا لكل تنسيق، نجح JAM-2 في توليد جزيئات ارتباط بمنطقة بيكومولار أو نانومولار ذات رقم واحد (single-digit nanomolar) لـ نصف هذه الأهداف. وعلى 10 أهداف أخرى، كل منها يحتوي على 20 منطقة ارتباط (epitope) محددة مسبقًا من قبل المستخدم، أنتج JAM-2 جزيئات ارتباط من نوع VHH-Fc لـ 30-70٪ من هذه المناطق على نصف الأهداف. وبشكل ملحوظ، نجح JAM-2 أيضًا في إنتاج جزيئات ارتباط مباشرة ببروتينات GPCR (البروتينات المربوطة بالغشاء) CXCR4 وCXCR7 في بيئات خلوية طبيعية، بتحقيق معدلات نجاح قدرها 11.7٪ و3.8٪ على التوالي، مع وصول أفضل التصاميم إلى قدرات ارتباط بمنطقة نانومولار ذات رقم واحد. أظهر تحليل قابلية التطوير (developability profiling) لمئات التصاميم de novo – وهو أكبر مجموعة بيانات متعلقة بالقابلية للتطوير في الأدوية البيولوجية المُصممة حسابيًا – أن أكثر من نصف التصاميم تحقق المعايير الأساسية الصناعية، بينما أظهرت العديد من التصاميم الرائدة ملفات سلوكية ذات جودة عالية تُعد كافية دون الحاجة إلى أي تحسينات إضافية. تُعد هذه النتائج JAM-2 النظام الرائد في مجال تصميم الأجسام المضادة de novo، وال-FIRST system جاهزًا للاستخدام الميداني في مراحل اكتشاف الأدوية، مُنافسًا أو حتى تفوقًا الطرق التقليدية للاكتشاف.
بناء الذكاء الاصطناعي بالذكاء الاصطناعي
من الفكرة إلى الإطلاق — عجّل تطوير الذكاء الاصطناعي الخاص بك من خلال البرمجة المشتركة المجانية بالذكاء الاصطناعي، وبيئة جاهزة للاستخدام، وأفضل أسعار لوحدات معالجة الرسومات.