مجموعات البيانات المستخدمة في بحث نموذج التعلم الانتقالي TandemMod

تحتوي هذه المجموعة من البيانات علىيتيح التعلم بالنقل التعرف على أنواع متعددة من تعديلات الحمض النووي الريبي باستخدام تسلسل الحمض النووي الريبي المباشر النانوي"مجموعات البيانات ذات الصلة المستخدمة في البحث، كل ملف لديه رمز مماثل، والمحتويات المحددة هي كما يلي:

تأتي مجموعة بيانات DRS المنشورة المستخدمة في هذه الدراسة من عمل مختبر نوفوا في المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI)، الولايات المتحدة الأمريكية، تحت رقم GSE124309 ، PRJNA563591 ، وعمل إنتاوات نوكايو، رقم. SRP166020 (غير متوفر في هذه المجموعة من البيانات بعد).

تتوفر بيانات DRS للعديد من خطوط الخلايا البشرية المستخدمة في هذه الدراسة للعامة من مشروع تعبير Nanopore في سنغافورة ومتاحة في الأرشيف الأوروبي للنوكليوتيدات (ENA) تحت رقم الوصول PRJEB44348 (غير متوفر في هذه المجموعة من البيانات بعد). أرز ⁶ بيانات A-seq مأخوذة من قاعدة بيانات Gene Expression Omnibus (GEO)، رقم GSE135549 . تتوفر بيانات m6ACE-Seq وmiCLIP لخط خلايا HEK293T البشرية في قاعدة بيانات GEO تحت أرقام الوصول GSE124509 و GSE63753 . يتوفر MeRIP-seq لخط الخلايا البشرية K562 في قاعدة بيانات GEO تحت رقم الوصول GSE205709 . تم إيداع أربع مجموعات بيانات من النسخ الظاهري في المختبر (IVET)، ومجموعتي بيانات IVT من التسلسلات الاصطناعية، ومجموعتي بيانات الأرز الناتجتين عن تسلسل الحمض النووي الريبي المباشر في ONT في قاعدة بيانات GEO تحت أرقام الوصول GSE227087 .