STARmap&MERFISH 小鼠细胞-基因对数据集

该数据集为论文「Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding」中，所使用的其中两个小鼠细胞-基因对数据集：MERFISH 小鼠数据集和 STARmap 小鼠数据集。

该研究对两个数据集进行了预处理：

• 对于 STARmap 小鼠 PLA 数据集，标准化的细胞-基因矩阵由原始论文提供并进行了对数转换。

• 对于 MERFISH 小鼠 AB 数据集，从 CELL x GENE 库获得基因计数矩阵。每个细胞的总计数标准化为 10,000，然后对标准化的细胞-基因矩阵进行对数转换。