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AI预测线粒体蛋白互作,提示疾病新靶点

德州农工大学农业与生命科学研究中心研究人员借助谷歌深层思维开发的蛋白质复合物结构预测模型,系统筛查人类线粒体蛋白之间的相互作用,为解读未知蛋白功能并寻找疾病治疗靶点提供新工具。人类线粒体约含一千一百种蛋白,其功能长期不明,而近三成相关蛋白突变与癌症、帕金森病、阿尔茨海默病及罕见遗传代谢病有关。团队将模型用于互作分类,对约一千一百种蛋白的六十三万余种配对进行计算预测,在《自然通讯》发表论文称发现两千八百九十五个潜在相互作用,其中逾半此前未见报道。研究人员用两年时间在酵母和人类细胞中验证多项预测,并与圣路易斯华盛顿大学医学院合作确认结果。该研究还为八十五个此前未表征蛋白找到首个可能伙伴,并把预测结果开放为在线资源,供全球科学家查询疾病相关蛋白和潜在通路。第一作者斯瓦米纳坦和教授戈希尔表示,这一做法可帮助传统生化与遗传学实验室绕过难以直接检测的蛋白互作,快速锁定值得验证的分子组合,为诊断和药物研发提供路线图。

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