近日，中国科学院上海有机化学研究所成功开发原子互作生成模型Void-X，为蛋白质界面设计提供全新范式。该模型突破传统自上而下的整体结构构建思路，采用自下而上的原子填充策略，能够针对特定结构区域直接生成匹配的互作原子分布，精准填补蛋白质界面空位。研究团队从蛋白质数据库中筛选构建逾800万个球形原子簇进行训练，模型含1.7亿参数，在链内与链间原子簇预测任务中准确率分别达78.3%与68.2%。Void-X将原子级精细信息与生成式人工智能深度融合，实现了对蛋白质及药物相互作用在原子尺度的精准预测与定向调控。随着腺相关病毒与mRNA脂质纳米颗粒等递送技术的成熟，基于该模型设计的特异性蛋白质可实现高效组织靶向递送。这一成果不仅丰富了生物分子界面的理性设计手段，更为加速创新疗法开发、满足未竟医疗需求开辟了广阔路径。相关研究已发表于《美国国家科学院院刊》。