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AI 揭秘:复杂生命的单细胞祖先比想象中更精密,早已具备“真核工具箱”

新研究表明,孕育复杂生命的单细胞祖先远比我们想象的更为复杂。长期以来,科学界普遍认为这一祖先类似于简单的细菌,缺乏现代真核细胞的 sophistication。然而,发表在《自然微生物学》和《自然》上的最新研究揭示,它可能已经拥有了一套惊人的分子工具包,为后续从酵母到蓝鲸等所有多细胞生命的演化奠定了基础。 瓦赫宁根大学的蒂亚斯·埃特玛教授团队采取了独特的研究策略。他们通过对比现代真核生物与十年前才在深海沉积物中发现的“阿斯加德古菌”——这两者的共同祖先——来追溯进化源头。由于过去二十亿年的基因突变使得仅凭 DNA 序列难以发现关联,研究人员转而利用人工智能工具(如 AlphaFold)预测并分析了超过 35,000 种古菌蛋白的三维结构。 分析结果令人震惊:阿斯加德古菌中竟包含约 1300 种此前被认为仅存在于真核生物中的蛋白质。这些蛋白质负责细胞内运输、储存以及形成细胞 compartment,正是构建复杂细胞的关键特征。这暗示我们的单细胞祖先早已具备了向复杂生命演化的潜能。此外,显微镜观察也证实,部分阿斯加德古菌拥有类似触角的突起和内部囊泡结构,进一步佐证了这一观点。 更令人意外的是,研究团队还在富氧环境中发现了阿斯加德古菌,并发现其具备处理氧气的基因。这意味着这些微生物可能已适应含氧环境,甚至能像真核生物一样利用氧气产生能量。这一发现挑战了古菌仅生存于无氧环境的传统认知。 十年前,受限于数据和技术,科学家仅凭单一基因序列发现了微弱线索,充满不确定性。如今,随着基因测序和 AI 预测技术的飞跃,这一古老谜题终于得到清晰解答。虽然关于祖先蛋白的具体功能细节仍有待探索,但可以确定的是,我们共同的单细胞祖先并非简陋的原始细胞,而是早已具备迈向复杂生命的关键技术储备。

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