10 天前
无标记组织在成像质谱中的虚拟染色
Yijie Zhang, Luzhe Huang, Nir Pillar, Yuzhu Li, Yuhang Li, Lukasz G. Migas, Raf Van de Plas, et al

摘要
质谱成像(Imaging Mass Spectrometry, IMS)能够在生物组织中实现无目标、高度多重化的分子物种定位,具有前所未有的化学特异性和灵敏度。然而,目前大多数IMS平台的空间分辨率较低,缺乏细胞形态学对比度,因此需要后续进行组织化学染色、显微成像以及先进的图像配准,才能将分子分布与特定组织特征及细胞类型相关联。本文提出一种基于扩散模型的虚拟组织染色方法,可提升质谱图像的空间分辨率,并在无标记的人类组织质谱图像中数字化引入细胞形态学对比。对人类肾组织的盲法测试表明,该方法生成的虚拟染色图像与实际组织化学染色图像(采用过碘酸-雪夫染色法)高度一致,在识别关键肾病理结构方面表现出良好的一致性,即使所使用的IMS数据像素尺寸比常规方法大10倍亦然。此外,本方法在扩散模型推理过程中采用优化的噪声采样策略,实现了可靠且可重复的虚拟染色效果。我们相信,这一虚拟染色技术将为基于质谱成像的生物医学研究开辟新的途径。