12 天前

你确定这是伪影吗?组织病理图像中的伪影检测与不确定性量化

{Kjersti Engan, Rafael Molina, Tahlita C.M. Zuiverloon, Umay Kiraz, Miguel López-Pérez, Neel Kanwal}
摘要

现代癌症诊断通常涉及从可疑区域获取组织样本,并通过组织技术处理流程制备数字化玻璃切片,即全切片图像(Whole Slide Image, WSI),以便进一步分析。然而,这些处理过程常会在生成的WSI中引入多种类型的伪影,若未被有效识别或处理,这些组织学伪影可能对后续计算病理学(Computational Pathology, CPATH)系统在诊断流程中的性能产生负面影响。尽管深度卷积神经网络(Deep Convolutional Neural Networks, DCNNs)在检测部分WSI伪影方面已取得令人瞩目的成果,但其预测结果缺乏不确定性估计。本文提出一种具备不确定性感知能力的深度核学习(Deep Kernel Learning, DKL)模型,用于检测两类常见WSI伪影:模糊区域与折叠组织。所提出的概率化模型融合了卷积神经网络(CNN)特征提取器与稀疏高斯过程(Sparse Gaussian Processes, GPs)分类器,不仅提升了当前最先进的DCNN伪影检测模型的性能,还能提供可靠的预测不确定性估计。在未见过的数据上,该模型在模糊检测和折叠组织检测任务中分别取得了0.996和0.938的F1分数。在大量跨队列、跨染色方法及不同组织类型的外部独立数据集上的实验验证表明,DKL模型显著优于传统DCNN方法。值得注意的是,DKL模型在正确预测时表现出更高的置信度,而在错误预测时则表现出较低的置信度。因此,该DKL模型可有效集成至CPATH系统的预处理流程中,提供稳健可靠的伪影检测结果,有望作为病理图像质量控制的重要工具。

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