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通过分子指纹组合预测ADMET性质

James H. Notwell Michael W. Wood

摘要

在研究预测小分子效力的方法时,我们发现随机森林和支持向量机与扩展连接性指纹(ECFP)结合使用时,始终优于最近开发的方法。对回归算法和分子指纹的详细研究表明,梯度提升决策树(特别是CatBoost)与ECFP、Avalon和ErG指纹的组合以及200个分子性质相结合最为有效。加入图神经网络指纹进一步提高了性能。我们在22个治疗数据共享联盟(Therapeutics Data Commons)ADMET基准测试中成功验证了我们的模型。我们的研究结果强调了丰富的分子表示对于准确预测性质的重要性。


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