17 天前

MIA-Prognosis:一种用于预测治疗反应的深度学习框架

Jiancheng Yang, Jiajun Chen, Kaiming Kuang, Tiancheng Lin, Junjun He, Bingbing Ni
MIA-Prognosis:一种用于预测治疗反应的深度学习框架
摘要

准确预测临床结局具有重要意义,但仍是极具挑战性的任务。目前的研究致力于寻找与治疗反应和/或患者生存密切相关的显著生物标志物。然而,这些生物标志物通常成本高昂、侵入性强,且可能难以满足新型治疗方案的需求。另一方面,临床实践中持续生成大量多模态、异构且未对齐的时序数据。本文旨在提出一种统一的深度学习方法,利用易于获取的数据(如影像学、实验室检查及临床信息)实现患者预后与治疗反应的联合预测。以往研究多集中于单一数据模态的建模,或忽略了时间动态变化的影响。尤为重要的是,临床时序数据在实际中往往是异步的,即以不规则的时间间隔记录。为此,本研究将预后建模形式化为一个多模态异步时序分类任务,并提出MIA-Prognosis框架,整合测量(Measurement)、干预(Intervention)与评估(Assessment)三类信息以预测治疗反应。该框架中设计了一种简化的时序注意力机制(Simple Temporal Attention, SimTA),用于有效处理异步时序数据。在合成数据集上的实验验证了SimTA相较于标准RNN方法的优越性。此外,我们在一项自建的、回顾性的真实世界非小细胞肺癌患者队列数据集上进行了实验,该队列患者接受抗PD-1免疫治疗。结果表明,所提出的方法在预测免疫治疗反应方面表现优异,尤其值得注意的是,该预测模型能够进一步对长期生存风险进行分层,有效识别出低风险与高风险患者群体。