2 个月前

基于条件图逻辑网络的逆合成预测

Hanjun Dai; Chengtao Li; Connor W. Coley; Bo Dai; Le Song
基于条件图逻辑网络的逆合成预测
摘要

逆合成分析是有机化学中的一个基本问题,其任务是识别可用于合成指定产物分子的反应物。近年来,计算机辅助逆合成分析重新引起了化学和计算机科学界的关注。现有的大多数方法依赖于基于模板的模型,这些模型定义了子图匹配规则,但化学反应是否能够进行并非由严格的决策规则决定。在本研究中,我们提出了一种新的方法来解决这一问题,该方法利用条件图逻辑网络(Conditional Graph Logic Network),这是一种建立在图神经网络基础上的条件图形模型,能够学习何时应用来自反应模板的规则,并隐式地考虑生成的反应是否既具有化学可行性又具有战略意义。此外,我们还提出了一种高效的层次采样方法以减轻计算成本。在基准数据集上,我们的模型相比当前最先进的方法实现了显著的8.1%提升,并且为预测提供了解释。

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