كشفت دراسة حديثة نُشرت في مجلة الفيزياء التقييمية إيه عن تقدم علمي في مجال النمذجة الحاسوبية للتفاعلات البروتينية، حيث طوّر فريق بحثي من جامعة ييل نموذجاً جديداً أبسط وأكثر دقة للتنبؤ بكيفية ارتباط البروتينات ببعضها لتكوين مجمعات خلوية. وتلعب هذه التفاعلات دوراً محورياً في الوظائف البيولوجية كالدفاع المناعي ونقل الأيونات، وقد يمهد الفهم الدقيق لها الطريق نحو تصميم أدوية مستهدفة ومجمعات بروتينية اصطناعية. تواجه الأبحاث في هذا المجال تحدياً يتمثل في ندرة البيانات البنائية عالية الدقة، إذ تتوفر هياكل دقيقة لألفي بروتين فقط من بين عشرة آلاف نوع في جسم الإنسان، مما يعيق تحديد وظائفها الدقيقة أو ارتباطها بالأمراض. ونظراً للتكلفة والوقت الباهظين للاختبارات المخبرية، يعتمد العلماء على المحاكاة الحاسوبية للتنبؤ بأزواج البروتينات القادرة على الارتباط. غير أن البروفيسور كوري أو هيرن قائد الدراسة أظهر أن الدوال التقييمية الحالية المستخدمة في هذا المجال تعاني من قصور منهجي، حيث تعتمد بشكل مفرط على مهام التصنيف وتفتقر إلى الدقة في اختبارات الانحدار التي تقيس الجودة الفعلية للنماذج التنبؤية. للتعامل مع هذا القصور، صمم الباحثون دالة تقييم جديدة تعتمد على نموذج انحدار الدعم الآلي المبسط، الذي يستند إلى ميزتين فيزيائيتين فقط: حجم منطقة الارتباط بين البروتينين ودرجة تشابكهما عند نقطة التقاء السطحين. وبمقارنة هذا النموذج مع سبع من أحدث الدوال التقييمية المعتمدة عالمياً، تبين تفوقه في الدقة والاستقرار. ويؤكد الفريق أن تركيز المرحلة الحالية انصب على التنبؤ بمنطقة الارتباط بين أزواج بروتينية ذات هياكل ثابتة، فيما ستوجه الجهود المستقبلية نحو تطوير خوارزميات قادرة على التعامل مع أشكال بروتينية ديناميكية أو غير معروفة الهيكل مسبقاً، مما يوسع الأفق أمام الاكتشافات الطبية والحيوية بكفاءة حاسوبية أعلى وتكلفة أقل.