استخدام وصفات الأدوية وهيكل الجزيئات لاستخراج التفاعلات الدوائية من الأدبيات

الدافعتتطلب الطرق العصبية لاستخراج التفاعلات الدوائية-الدوائية (DDIs) من الأدبيات عددًا كبيرًا من التصنيفات (التعليقات). في هذه الدراسة، نقترح طريقة جديدة لاستخدام فعّال لمعلومات قواعد البيانات الخارجية للعقاقير، فضلًا عن المعلومات المستمدة من النصوص المسطحة على نطاق واسع لاستخراج التفاعلات الدوائية. وبشكل خاص، نركّز على معلومات وصف الدواء وبنية الجزيء كمصدر للمعلومات من قواعد بيانات الأدوية.النتائجقمنا بتقييم منهجنا على مجموعة بيانات مشاركة DDIExtraction 2013. وقد توصلنا إلى النتائج التالية: أولاً، يمكن أن تُحسّن المعلومات النصية الخام على نطاق واسع من أداء استخراج التفاعلات الدوائية بشكل كبير عند دمجها مع النموذج الحالي، وتُظهر أداءً يُعدّ من أفضل الأداءات الحالية (state-of-the-art). ثانيًا، تُسهم كل من معلومات وصف الدواء وبنية الجزيء في تحسين أداء استخراج التفاعلات الدوائية بشكل ملحوظ بالنسبة لبعض أنواع التفاعلات الدوائية المحددة. ثالثًا، يمكن أن يؤدي الاستخدام المتزامن لمعلومات وصف الدواء وبنية الجزيء إلى تحسين كبير في الأداء بالنسبة لجميع أنواع التفاعلات الدوائية. وقد أظهرنا أن النصوص المسطحة، ومعلومات وصف الدواء، وبيانات البنية الجزيئية مكملة لبعضها البعض، وأن الجمع الفعّال بينها ضروري لتحسين الأداء.