HyperAIHyperAI

Command Palette

Search for a command to run...

منذ 4 أشهر

Polaratio: معامل ارتباط تنازلي يعتمد على الحجم، وتحسيناته لتركيب الخلايا القصيرة RNA

{Chandra Mohan Anto Sam Crosslee Louis Sam Titus Pietro Antonio Cicalese Victor Wang}

الملخص

الدافع: سمحَت تقنيات تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) وأدوات التحليل بتحقيق فهم مفصل بشكل ملحوظ للدور والتفاعلات بين الخلايا والجينات. ومع ذلك، فإن المقاييس التقليدية للمسافة، مثل المسافة الإقليدية، ومسافة بيرسون، ومسافة سبيرمان، تفشل في أخذ الابعاد العالية، والتزايدية، وحجم تعبير الجينات بعين الاعتبار في آنٍ واحد. ولحل عدة نقاط ضعف في هذه المقاييس الشائعة الاستخدام، نقدم مقياسًا جديدًا يُسمى "Polaratio"، وهو مقياس ارتباط تزايدي يعتمد على الحجم، مصمم لتحسين جودة تحليل بيانات scRNA-seq.النتائج: قمنا بدمج ثلاث خوارزميات تجميع متميزة وقابلة للتفسير – تجميع الخلايا الموحّد (SC3)، والتجميع الهرمي (HC)، وتجميع K-متوسطات (KM) – من خلال إجراء تجميع خلايا موحّد، وقمنا بتقييمه على مجموعة متنوعة من البيانات البيولوجية لمقارنة أداء Polaratio مع عدة مقاييس معروفة. أظهرت نتائجنا قدرة Polaratio على تحسين دقة تجميع الخلايا في 5 من أصل 7 مجموعات بيانات متاحة علنًا.التوفر: https://github.com/dubai03nsr/Polaratioالاتصال: pcicalese@uh.edu

المعايير القياسية

معيار قياسيالمنهجيةالمقاييس
graph-clustering-on-biase-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 1.000
graph-clustering-on-bozec-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.571
graph-clustering-on-deng-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.459
graph-clustering-on-goolam-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.914
graph-clustering-on-pollen-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.953
graph-clustering-on-treutlein-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.812
graph-clustering-on-yan-et-alPolaratio Consensus Clustering
Adjusted Rand Index: 0.811

بناء الذكاء الاصطناعي بالذكاء الاصطناعي

من الفكرة إلى الإطلاق — عجّل تطوير الذكاء الاصطناعي الخاص بك من خلال البرمجة المشتركة المجانية بالذكاء الاصطناعي، وبيئة جاهزة للاستخدام، وأفضل أسعار لوحدات معالجة الرسومات.

البرمجة المشتركة بالذكاء الاصطناعي
وحدات معالجة رسومات جاهزة
أفضل الأسعار
ابدأ الآن

Hyper Newsletters

اشترك في آخر تحديثاتنا
سنرسل لك أحدث التحديثات الأسبوعية إلى بريدك الإلكتروني في الساعة التاسعة من صباح كل يوم اثنين
مدعوم بواسطة MailChimp
Polaratio: معامل ارتباط تنازلي يعتمد على الحجم، وتحسيناته لتركيب الخلايا القصيرة RNA | الأوراق البحثية | HyperAI