HyperAIHyperAI

Command Palette

Search for a command to run...

منذ 4 أشهر

O-GNN: دمج الاحتمالات الحلقيّة في النمذجة الجزيئية

O-GNN: دمج الاحتمالات الحلقيّة في النمذجة الجزيئية

الملخص

المركبات الدائرية التي تحتوي على حلقة واحدة على الأقل تلعب دورًا مهمًا في تصميم الأدوية. وعلى الرغم من النجاح الأخير في النمذجة الجزيئية باستخدام الشبكات العصبية الرسومية (GNN)، فإن عدد النماذج التي تأخذ الحلقات في المركبات بعين الاعتبار بشكل صريح يظل محدودًا، مما يحد من قدرة النماذج على التعبير عن البنية الجزيئية بدقة. في هذا العمل، نصمم نموذجًا جديدًا من الشبكات العصبية الرسومية، يُعرف باسم GNN المُعزّز بالحلقات (O-GNN)، والذي يُمثّل الحلقات بشكل صريح إلى جانب تمثيل الذرات والروابط في الجزيئات. في نموذج O-GNN، تُمثّل كل حلقة بواسطة متجه خفي، يساهم في التمثيل العام للجزيء ويتغير تدريجيًا بناءً على تمثيلات الذرات والروابط. تُظهر التحليلات النظرية أن O-GNN قادر على التمييز بين مجموعتين فرعيتين متماثلتين تقعان على حلقتين مختلفتين باستخدام طبقة واحدة فقط، في حين أن الشبكات العصبية الرسومية التقليدية تتطلب عدة طبقات لتحقيق هذا التمييز، مما يدل على أن O-GNN أكثر تعبيرًا. أظهرت التجارب أداءً جيدًا لنموذج O-GNN على مجموعات بيانات عامة، حيث حقق نتائج رائدة في معيار PCQM4Mv1 (متفوقًا على الحل السابق الفائز في مسابقة KDDCup)، وفي مهمة توقع التفاعل بين الأدوية على منصة DrugBank. علاوة على ذلك، تفوق O-GNN على النماذج القوية (التي لا تأخذ الحلقات بعين الاعتبار) في مهام توقع الخصائص الجزيئية وتوقع التصنيع العكسي.

المعايير القياسية

معيار قياسيالمنهجيةالمقاييس
graph-regression-on-pcqm4m-lscO-GNN
Validation MAE: 0.1148
single-step-retrosynthesis-on-uspto-50kO-GNN (reaction class as prior)
Top-1 accuracy: 65.7
Top-10 accuracy: 96.9
Top-3 accuracy: 87.7
Top-5 accuracy: 93.4
Top-50 accuracy: 98.3
single-step-retrosynthesis-on-uspto-50kO-GNN (reaction class unknown)
Top-1 accuracy: 54.1
Top-10 accuracy: 92.5
Top-3 accuracy: 77.7
Top-5 accuracy: 86.0
Top-50 accuracy: 98.2

بناء الذكاء الاصطناعي بالذكاء الاصطناعي

من الفكرة إلى الإطلاق — عجّل تطوير الذكاء الاصطناعي الخاص بك من خلال البرمجة المشتركة المجانية بالذكاء الاصطناعي، وبيئة جاهزة للاستخدام، وأفضل أسعار لوحدات معالجة الرسومات.

البرمجة المشتركة بالذكاء الاصطناعي
وحدات معالجة رسومات جاهزة
أفضل الأسعار
ابدأ الآن

Hyper Newsletters

اشترك في آخر تحديثاتنا
سنرسل لك أحدث التحديثات الأسبوعية إلى بريدك الإلكتروني في الساعة التاسعة من صباح كل يوم اثنين
مدعوم بواسطة MailChimp
O-GNN: دمج الاحتمالات الحلقيّة في النمذجة الجزيئية | الأوراق البحثية | HyperAI