مجموعة بيانات MitoEM: التجزئة الInstance ثلاثية الأبعاد على نطاق واسع للميتوكوندريا من صور EM

يُمكّن التصوير الإلكتروني (EM) من تحديد العضيات داخل الخلية مثل الميتوكوندريا، مما يوفر رؤى مهمة للدراسات السريرية والعلمية. ومع ذلك، فإن مجموعات البيانات العامة الخاصة بتحليل الميتوكوندريا تحتوي فقط على مئات الحالات ذات أشكال بسيطة. ولا يُعرف ما إذا كانت الطرق الحالية التي تحقق دقةً تُعادل مستوى البشر على هذه المجموعات الصغيرة تكون قوية في التطبيق العملي. وللإجابة على هذا السؤال، نقدم مجموعة بيانات MitoEM، وهي مجموعة بيانات ثلاثية الأبعاد لتحليل حالات الميتوكوندريا، تتضمن حجمين بحجم (30 ميكرومتر)³ من أنسجة القشرة البشرية والجرذية على التوالي، وتمتد بحجم يفوق المعايير السابقة بأكثر من 3600 مرة. وبوجود حوالي 40 ألف حالة، لاحظنا تنوعًا كبيرًا في شكل الميتوكوندريا وكثافتها. ولغرض التقييم، قمنا بتعديل تنفيذ معيار الدقة المتوسطة (AP) لبيانات ثلاثية الأبعاد، مع تحقيق تسريع بنسبة 45 مرة. وعند تطبيق هذه المجموعة على MitoEM، وجدنا أن الطرق الحالية لتحليل الحالات غالبًا ما تفشل في تحليل الميتوكوندريا ذات الأشكال المعقدة أو التي تلامس حالات أخرى بشكل وثيق. وبالتالي، تمثل مجموعة MitoEM تحديات جديدة للحقل. ونُعلن عن إتاحة رمز البرنامج والبيانات: https://donglaiw.github.io/page/mitoEM/index.html.