LIVECell—مجموعة بيانات كبيرة النطاق لتقسيم الخلايا الحية بدون علامات

يُسهّل التصوير الضوئي المدمج مع بروتوكولات مُثبتة جيدًا للثقافات الخلوية ثنائية الأبعاد إجراء التصوير الكمي عالي الإنتاجية لدراسة الظواهر البيولوجية. وتمكّن التقنيات الدقيقة لتقسيم الخلايا الفردية في الصور من استكشاف أسئلة بيولوجية معقدة، لكنها قد تتطلب خطوط معالجة صور معقدة في الحالات التي تُظهر تباينًا منخفضًا وكثافة كائنات عالية. تُعتبر الأساليب القائمة على التعلم العميق هي الأحدث في مجال تقسيم الصور، لكنها عادةً ما تتطلب كميات هائلة من البيانات المُعلّمة، والتي لا تتوفر موارد مناسبة لها في مجال التصوير الخلوي دون علامات. نقدم هنا LIVECell، وهي مجموعة بيانات كبيرة وعالية الجودة، تم تسميتها يدويًا وتم التحقق من صحتها من قبل خبراء، وتتكون من صور متناوبة الطور، وتشمل أكثر من 1.6 مليون خلية من طيف متنوع من الأشكال الخلوية وكثافات ثقافات مختلفة. ولإثبات فعاليتها، قمنا بتدريب نماذج تعتمد على الشبكات العصبية التلافيفية باستخدام LIVECell، ثم قمنا بتقييم دقة تقسيم النماذج باستخدام مجموعة مُقترحة من المعايير المعيارية.