أدى البحث العالمي لمكافحة جائحة كوفيد-19 إلى عزل ووصف آلاف الأجسام المضادة البشرية الموجهة ضد بروتين الشوكة لفيروس سارس-كوف-2، مما فتح فرصة غير مسبوقة لدراسة الاستجابة المناعية للأجسام المضادة تجاه مضاد واحد. باستخدام المعلومات المستمدة من 88 نشرة بحثية و13 براءة اختراع، قمنا ببناء مجموعة بيانات تتضمن حوالي 8,000 جسم مضاد بشري موجه لبروتين الشوكة لفيروس سارس-كوف-2، مستمدة من أكثر من 200 متبرعًا. وبواسطة تحليل استخدام جينات المجال V وD للمناعية، وتحديثات مناطق التماثل المحددة للمناعة (CDR H3)، والطفرات الهدبية، أثبتنا أن الاستجابات المشتركة (العامة) تجاه المجالات المختلفة لبروتين الشوكة تختلف بشكل كبير. وتم استخدام هذه التسلسلات لتدريب نموذج تعليم عميق قادر على التمييز بدقة بين الأجسام المضادة البشرية الموجهة لبروتين الشوكة لفيروس سارس-كوف-2 والجسم المضاد الموجه لبروتين الهيماغلوتينين لفيروس الإنفلونزا. بشكل عام، يوفر هذا البحث موردًا معلوماتيًا قيمًا للبحث في الأجسام المضادة، ويُعزز فهمنا الجزيئي للاستجابات المناعية العامة.