منذ 10 أيام
IntFold: نموذج أساسي قابل للتحكم في التنبؤ بالهيكل البيولوجي العام والمتخصص
The IntFold Team, Leon Qiao, Wayne Bai, He Yan, Gary Liu, Nova Xi, Xiang Zhang

الملخص
نقدم IntFold، وهو نموذج أساسي قابل للتحكم في التنبؤ ببنية الجزيئات الحيوية سواء العامة أو المتخصصة. يظهر IntFold دقة تنبؤ مماثلة لأحدث النماذج المتطورة مثل AlphaFold3، مع استخدام نواة انتباه مخصصة أفضل. بالإضافة إلى التنبؤ بالهيكل القياسي، يمكن تكييف IntFold لتنبؤ الحالة التنظيمية (allosteric states)، الهياكل المقيدة (constrained structures)، وقوة الارتباط (binding affinity) من خلال استخدام مكيفات فردية. علاوة على ذلك، نقدم رأس ثقة جديد لتقدير جودة الرص (docking quality)، مما يوفر تقييمًا أكثر تعقيدًا للأهداف الصعبة مثل مركبات الأجسام المضادة والضد الأصلي. وأخيرًا، نشارك الرؤى التي تم الحصول عليها أثناء عملية تدريب هذا النموذج الحاسوبي المعقد.