HyperAIHyperAI

Command Palette

Search for a command to run...

GCBLANE: شبكة انتباه ثنائية التدفق متعددة التحفيزات مدعومة بالرسم البياني لتحسين توقع مواقع ارتباط عوامل النسخ

Jonas Chris Ferrao Dickson Dias Sweta Morajkar Manisha Gokuldas Fal Dessai

الملخص

تحديد مواقع ارتباط عوامل النسخ (TFBS) يُعد أمرًا بالغ الأهمية لفهم تنظيم الجينات، حيث تمكّن هذه المواقع عوامل النسخ (TFs) من الارتباط بالحمض النووي الريبي (DNA) وتعديل تعبير الجينات. وعلى الرغم من التقدم في تقنيات التسلسل عالي الإنتاجية، يظل تحديد مواقع ارتباط عوامل النسخ أمرًا صعبًا بسبب كثافة البيانات الجينومية وتعقيد أنماط الارتباط. تم تقديم نموذج GCBLANE، وهو شبكة انتباه مدعومة بالرسم البياني وتعتمد على التعلم التكراري ثنائي الاتجاه من نوع LSTM مع التحويلات التلافيفية، لمعالجة هذه المشكلة. حيث يدمج النموذج طبقات التحويل التلافيفي والانتباه متعدد الرؤوس والطبقات التكرارية مع شبكة عصبية رسمية (GNN) للكشف عن الميزات الأساسية المهمة لتنبؤ مواقع ارتباط عوامل النسخ. وقد حقق GCBLANE متوسط قيمة AUC بلغت 0.943 على 690 مجموعة بيانات ChIP-Seq من مشروع ENCODE، وبلغت القيمة 0.9495 على 165 مجموعة بيانات من نفس المشروع، متفوّقًا على النماذج المتقدمة التي تعتمد على نهج متعدد الأشكال، بما في ذلك معلومات شكل الحمض النووي. تُبرز هذه النتائج فعالية GCBLANE مقارنةً بالطرق الأخرى. وبدمج التعلم القائم على الرسوم البيانية مع تحليل التسلسل، يُعد GCBLANE تقدمًا كبيرًا في مجال تنبؤ مواقع ارتباط عوامل النسخ.


بناء الذكاء الاصطناعي بالذكاء الاصطناعي

من الفكرة إلى الإطلاق — سرّع تطوير الذكاء الاصطناعي الخاص بك مع المساعدة البرمجية المجانية بالذكاء الاصطناعي، وبيئة جاهزة للاستخدام، وأفضل أسعار لوحدات معالجة الرسومات.

البرمجة التعاونية باستخدام الذكاء الاصطناعي
وحدات GPU جاهزة للعمل
أفضل الأسعار

HyperAI Newsletters

اشترك في آخر تحديثاتنا
سنرسل لك أحدث التحديثات الأسبوعية إلى بريدك الإلكتروني في الساعة التاسعة من صباح كل يوم اثنين
مدعوم بواسطة MailChimp