HyperAIHyperAI

Command Palette

Search for a command to run...

نحو نموذج أفضل باستخدام الترانسفورمر المزدوج لتنبؤ استجابة الدواء

Kun Li Jia Wu Bo Du Sergey V. Petoukhov Huiting Xu Zheman Xiao Wentian Hu

الملخص

في السنوات الأخيرة، حققت الطرق المستندة إلى الشبكات العصبية الرسومية (GNN) نتائج ممتازة كمهمة رئيسية في تنبؤ استجابة الأدوية. تستخدم الطرق التقليدية للشبكات العصبية الرسومية فقط الذرات في جزيء الدواء كعقد لاستخلاص تمثيل الرسم البياني الجزيئي من خلال نقل المعلومات بين العقد، بينما يمكن للطريقة التي تستند إلى الترانسفورمر استخلاص معلومات عن العقد فحسب. ومع ذلك، فإن الروابط المشتركة والتشيرالية لجزيء الدواء لها تأثير كبير على الخصائص الصيدلانية للجزيء، وهذه المعلومات ملموسة في الروابط الكيميائية المكونة من الحواف بين الذرات. بالإضافة إلى ذلك، يمكن للطرق المستندة إلى الشبكات العصبية المتلافهة (CNN) لنمذجة سلاسل الجينوم الخلوية أن تدرك فقط المعلومات المحلية وليس المعلومات العالمية حول التسلسل.لحل المشكلات المذكورة أعلاه، نقترح هيكل الترانسفورمر الثنائي المنفصل مع تضمين الحواف لتنبؤ استجابة الدواء (TransEDRP)، والذي يستخدم لتمثيل سلاسل الجينوم الخلوية والدواء على حد سواء. بالنسبة لفرع الدواء، قمنا بتشفير معلومات الرابطة الكيميائية داخل الجزيء كتضمين للحافة في الرسم البياني الجزيئي، واستخلصنا المعلومات الهيكلية والبيوكيميائية العالمية للجزيء الدوائي باستخدام الترانسفورمر الرسومي. أما بالنسبة لفرع سلاسل الجينوم الخلوية، فقد استخدمنا آلية الانتباه متعددة الرؤوس لتمثيل التسلسل الجينومي عالمياً.أخيراً، يتم دمج فرعي الدواء وسلاسل الجينوم من خلال طبقة الترانسفورمر وطبقة الاتصال الكاملة لتوقع قيم IC50، حيث يمثل الفرعين نوعين مختلفين من الوسائط المتعددة. أظهرت التجارب الواسعة أن طريقتنا أفضل من النهج الرئيسية الحالية في جميع مؤشرات التقييم.


بناء الذكاء الاصطناعي بالذكاء الاصطناعي

من الفكرة إلى الإطلاق — سرّع تطوير الذكاء الاصطناعي الخاص بك مع المساعدة البرمجية المجانية بالذكاء الاصطناعي، وبيئة جاهزة للاستخدام، وأفضل أسعار لوحدات معالجة الرسومات.

البرمجة التعاونية باستخدام الذكاء الاصطناعي
وحدات GPU جاهزة للعمل
أفضل الأسعار

HyperAI Newsletters

اشترك في آخر تحديثاتنا
سنرسل لك أحدث التحديثات الأسبوعية إلى بريدك الإلكتروني في الساعة التاسعة من صباح كل يوم اثنين
مدعوم بواسطة MailChimp