منذ 15 أيام
CellTypeGraph: معيار جديد للرؤية الحاسوبية الهندسية
Lorenzo Cerrone, Athul Vijayan, Tejasvinee Mody, Kay Schneitz, Fred A. Hamprecht
الملخص
تصنيف جميع الخلايا في عضو ما يُعد مشكلة ذات أهمية وصعوبة كبيرة في علم تطور النباتات. نُقدّم هنا تحويل هذه المشكلة إلى معيار جديد لتصنيف العقد في رسم بياني مُحَدَّد مكانيًا. وحل هذه المشكلة يتطلب تعلُّم التكوين المكاني للعضو بما في ذلك التناظرات. ولتمكين الاختبار السهل للطرق الجديدة للتعلم الهندسي، تم توفير المعيار الخاص ببويضات نبات عباد الشمس (Arabidopsis thaliana) كمحمل بيانات (data loader) متوافق مع PyTorch، إلى جانب عدد كبير من السمات المُحسوبة مسبقًا. وأخيرًا، قمنا بقياس أداء ثمانية معمارية حديثة من الشبكات العصبية الرسومية، ووجدنا أن نموذج DeeperGCN يُعد الأفضل حاليًا في معالجة هذه المشكلة.