HyperAIHyperAI
منذ 2 أشهر

اكتشاف الخلايا باستخدام المضلعات النجمية المحدبة

Uwe Schmidt; Martin Weigert; Coleman Broaddus; Gene Myers
اكتشاف الخلايا باستخدام المضلعات النجمية المحدبة
الملخص

الكشف التلقائي وتقسيم الخلايا والنوى في صور المجهر مهم لعديد من التطبيقات الحيوية. تشمل الطرق الناجحة الحديثة التي تعتمد على التعلم تقسيم الخلايا على مستوى البكسل مع المجموعات اللاحقة للبكسلات، أو تحديد مربعات الحدود مع التحسين اللاحق للشكل. في حالات وجود خلايا مكتظة، يمكن أن تكون هذه الطرق عرضة لأخطاء التقسيم، مثل دمج الخلايا المتاخمة بشكل خاطئ أو إغفال حالات الخلايا الصحيحة بسبب التقريب السيء بمربعات الحدود. لتجاوز هذه المشكلات، نقترح تحديد نوى الخلايا عبر مضلعات نجمية محدبة (star-convex polygons)، وهي تمثل الشكل بشكل أفضل بكثير مقارنة بمربعات الحدود وبالتالي لا تحتاج إلى تحسين الشكل. لهذا الغرض، نقوم بتدريب شبكة عصبية ارتباطية تتنبأ لكل بكسل بمضلع للخلية الموجودة في تلك الموضع. نوضح فوائد منهجيتنا على قاعدتين بيانات صناعيتين وقاعدة بيانات ثالثة صعبة تحتوي على صور مجهرية متعددة الألوان الفلورية.