1. 튜토리얼 소개

MAGE(Monoclonal Antibody Generator)는 밴더빌트 대학교 의료센터(VUMC)의 IGLAB(Immunogenomics Lab) 팀에서 2024년 6월에 발표한 서열 기반 단백질 언어 모델(PLM)입니다. 이 모델은 특정 표적에 대한 인간 가변 중쇄 및 경쇄 항체 서열 쌍을 생성하도록 정밀하게 조정되었습니다. MAGE는 SARS-CoV-2, 신종 조류 인플루엔자 H5N1, 그리고 호흡기 세포융합 바이러스 A(RSV-A)에 대해 실험적으로 검증된 결합 특이성을 갖는 새롭고 다양한 항체 서열을 생성할 수 있음이 입증되었습니다. 관련 연구 결과는 다음 논문에서 확인할 수 있습니다. 대규모 언어 모델을 이용한 항원 특이적 쌍쇄 항체 생성 .

이 튜토리얼에서는 리소스로 단일 RTX 5090 카드를 사용합니다.

2. 프로젝트 예시

3. 작업 단계

1. 컨테이너 시작 후 API 주소를 클릭하여 웹 인터페이스로 진입합니다.

2. 사용 단계

"잘못된 게이트웨이"가 표시되면 모델이 초기화 중임을 의미합니다. 모델이 크기 때문에 약 2~3분 정도 기다리신 후 페이지를 새로고침해 주시기 바랍니다.

알아채다:

항원 정보는 신호 펩티드 또는 막관통 영역을 제거한 아미노산 서열 형태로 제공해야 합니다.

예시: SARS-CoV-2 인덱스 균주 RBD: RVQPTESIVRFPNITNLCPGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFFCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKL PDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFPTNGVGYQPYRVLLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNF