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PLACERニューラルネットワーク
PLACER(タンパク質-リガンド原子論的コンフォメーションアンサンブルリゾルバー)は、ワシントン大学のデイビッド・ベイカー教授率いる研究チームによって2025年11月に提案されました。関連する研究成果は論文「…」に掲載されました。PLACERを用いたタンパク質-小分子コンフォメーションアンサンブルのモデリング”。
PLACERは、様々な有機小分子の原子構成と結合に関する知識に基づいて、その構造を正確に生成できるグラフニューラルネットワークです。タンパク質環境のより広範な記述を与えることで、タンパク質-小分子ドッキングのための小分子およびタンパク質側鎖構造を構築することもできます。PLACERは、小分子および小分子-タンパク質系のコンフォメーションセットの迅速な生成、ならびに高活性を有する事前組織化酵素の設計に広く応用できると考えられます。