内在的に無秩序なタンパク質やペプチドは生物学において重要な役割を果たしていますが、定義された構造の欠如と配列および構造的嗜好性の高い変動性により、これらのシステムを標的とするのは困難となっています。ペプチド特異的な抗体は免疫化またはライブラリ選択によって得られますが、これらの方法には相当な労力が必要であり、無秩序な抗原は注射後に分解されやすいという問題があります。したがって、配列に基づいて非折りたたみ状態のペプチドを認識できるタンパク質のインシリコ設計は重要な課題となっています。