要約
抗体は免疫系の重要な部分であり、不要な物体（抗原）を直接中和したり、将来の破壊のために標識化する機能を持っています。抗体が抗原に結合する部位であるパラトープに属するアミノ酸を予測できると、抗体設計が促進され、個別化医療の開発にも貢献します。最近、このタスクに対して深層ニューラルネットワークの適切性が確認されており、Parapredはこれまでのすべての物理モデルを上回る性能を示しています。私たちの貢献は二つあります：第一に、à trous畳み込みと自己注意機構を活用することで、Parapredの計算効率を大幅に向上させました。第二に、抗体残基が抗原残基に関与できるようにクロスモーダル注意機構を実装しました。これにより、このタスクにおいて新たな最先端の結果が得られるとともに、洞察的な解釈も可能になりました。