Xaira Therapeutics、次世代AI生物学モデル開発のために最大規模のゲノムワイドPerturb-seqデータセット「X-Atlas/Orion」公開

X-Atlas/Orion: Xaira Therapeuticsが次世代AIバイオロジーを牽引 カリフォルニア州サウスサンフランシスコ -- 2024年4月に設立されたXaira Therapeuticsは、「X-Atlas/Orion」の公開により、AI駆動型仮想細胞モデルの開発に大きな進展を遂げました。「X-Atlas/Orion」は最大規模の公開Perturb-seqアトラスで、単一細胞技術の進歩を受け、複雑な生命現象を解明することを目指す基礎モデルの発展に貢献します。このアトラスの生成には「Fix-Cryopreserve-ScRNAseq」（FiCS）Perturb-seqプラットフォームが使用されました。10x GenomicsのChromiumプラットフォームを活用したFiCSは、大規模データ生成に必要な感度、拡張性、再現性を提供します。 X-Atlas/Orionのデータセットには800万細胞が含まれ、すべての人類タンパク質 コード化遺伝子を対象としており、各細胞で16,000以上のユニークな分子識別子（UMIs）の深部シークエンスが行われています。このデータセットは、さまざまな遺伝子変異から生じる生物学的表現型の発見を可能にします。特にXairaチームは、介入強度に応じて遺伝子活性が変化するドーズ依存性遺伝子効果の検出メソッドを開発しました。従来、Perturb-seqでの遺伝子ノックダウンは「オン」「オフ」の切り替えと考えられていましたが、Xairaの手法は各細胞内の単一ガイドRNA（sgRNA）量を測定することで、遺伝子抑制の強度を連続変数として捉えられるようにしました。これにより、未来の因果モデルの予測力と生物学的洞察をより精密に強化できます。 Ci Chu氏、Xaira Therapeuticsの早期発見部門副社長兼プレプリントの上級著者は、「この産業化されたプラットフォームとOrionデータセットは、どのように細胞が異なる条件下で反応するかをモデル化する上で、規模と品質を提供します。それによって初世代の仮想細胞モデルの訓練に向けた重要なステップとなります」と述べています。またBo Wang氏、Xaira TherapeuticsのバイオメディカルAI部門SVP兼ヘッドは、「これが基盤となり、疾患メカニズムの解明やより賢い治療法の設計に備えられます」と評価しています。 業界の反響とXaira Therapeuticsの概要 Xaira Therapeuticsの共同創設者であるDavid Baker博士は、2024年10月にAI駆動型タンパク質構造予測と新たなタンパク質設計における先駆的な業績でノーベル化学賞を受賞しました。これはGoogle DeepMindのDemis Hassabis氏とJohn Jumper氏と共受賞したものです。Xairaは今後、これらの成果を活かしながら、生物学的標的とエンジニアリングされた分子を疾患における人間の体験とつなげる新しい手法の開発を推進します。 Xaira Therapeuticsは、AIを用いて生命の言語を学び、疾患治療の方法を変革することで統合されたバイオ技術企業です。機械学習研究、拡大可能なデータ生成、堅牢な治療製品開発という3つの核心分野にトップレベルの人材を集め、ドラッグディスカバリから製薬までのプロセスを一から見直しています。本社はサンフランドシスコ湾地区に位置しています。