tcbb2014 データセットは、DrugBank、KEGG Drug、DCDB、および Matador から収集されており、315 の薬物、250 のターゲット、薬物間の 5 つの類似性カテゴリ、およびターゲット間の 3 つの類似性カテゴリが含まれています。薬物間の類似性には、化学、リガンド、性能、副作用、および注釈の類似性が含まれます。ターゲット間の類似性には、配列、タンパク質間相互作用ネットワーク、遺伝子オントロジーの類似性が含まれます。このデータセットの本来のタスクは、ネットワーク内のさまざまな種類の類似性に基づいて、薬物と標的の間の新しい相互作用を予測することです。

引用

@article{fakharei2014network, タイトル={確率的ソフトロジックを用いたネットワークベースの薬剤標的相互作用予測} author={Fakhraei、Shobeir と Huang、Bert と Raschid、Louiqa と Getoor、Lise}、 ジャーナル={IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics}、 年={2014}、 }