PLACER-Neuronales Netzwerk
PLACER (Protein-Ligand Atomistic Conformational Ensemble Resolver) wurde im November 2025 von einem Forschungsteam unter der Leitung von Professor David Baker an der University of Washington vorgeschlagen. Die zugehörigen Forschungsergebnisse wurden in der Publikation „…“ veröffentlicht.Modellierung von Protein-Kleinmolekül-Konformationsensembles mit PLACER".
PLACER ist ein Graph-Neuronales Netzwerk, das anhand der atomaren Zusammensetzung und Bindungsverhältnisse präzise Strukturen verschiedener kleiner organischer Moleküle generieren kann. Mit einer umfassenderen Beschreibung der Proteinumgebung kann es zudem Strukturen kleiner Moleküle und Proteinseitenketten für das Protein-Kleinmolekül-Docking erstellen. PLACER ist breit anwendbar für die schnelle Generierung von Konformationssätzen kleiner Moleküle und Kleinmolekül-Protein-Systemen sowie für die Entwicklung präorganisierter Enzyme mit höherer Aktivität.
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