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Vorhersage von Moleküleigenschaften basierend auf räumlicher Graphen-Embedding

Xiao-Feng Wang Zhiqiang Wei Shugang Zhang Shuang Wang Mingjian Jiang Zhen Li

Zusammenfassung

Die präzise Vorhersage molekularer Eigenschaften ist entscheidend für die Entwicklung neuer Verbindungen und stellt einen zentralen Schritt im Arzneimittelentdeckungsprozess dar. In diesem Beitrag wird molekularer Graphen-Datenmaterial zur Eigenschaftsvorhersage mithilfe von Graphen-Konvolutionsneuralen Netzen genutzt. Zudem wird eine Konvolutionsraum-Graph-Embedding-Schicht (C-SGEL) vorgestellt, die die räumlichen Verbindungsstrukturen in Molekülen bewahrt. Mehrere C-SGEL-Schichten werden gestapelt, um ein Konvolutionsraum-Graph-Embedding-Netzwerk (C-SGEN) für die end-to-end-Repräsentationslernung zu konstruieren. Um die Robustheit des Netzwerks zu erhöhen, werden molekulare Fingerprints zudem mit dem C-SGEN kombiniert, um ein hybrides Modell zur Vorhersage molekularer Eigenschaften zu entwickeln. Unsere vergleichenden Experimente zeigen, dass unsere Methode präzise ist und auf mehreren offenen Benchmark-Datensätzen die besten Ergebnisse erzielt.


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