Eine großflächige systematische Untersuchung enthüllt wiederkehrende molekulare Merkmale öffentlicher Antikörperantworten auf SARS-CoV-2

Die weltweite Forschung zur Bekämpfung der COVID-19-Pandemie hat die Isolierung und Charakterisierung von Tausenden menschlicher Antikörper gegen das SARS-CoV-2-Spikes蛋白 ermöglicht und bot damit eine beispiellose Gelegenheit, die Antikörperantwort auf ein einzelnes Antigen zu untersuchen. Auf der Grundlage von 88 Forschungsarbeiten und 13 Patenten haben wir ein Datenset mit etwa 8.000 menschlichen Antikörpern gegen das SARS-CoV-2-Spikesprotein aus über 200 Spendern zusammengestellt. Durch die Analyse der Nutzung von Immunoglobulin-V- und D-Genen, der Komplementaritätsbestimmungsbereich-H3-Sequenzen sowie der somatischen Hypermutationen zeigten wir, dass die gemeinsamen (öffentlichen) Antikörperantworten auf unterschiedliche Domänen des Spikes Proteins erheblich voneinander abwichen. Darüber hinaus nutzten wir diese Sequenzen, um ein tiefes Lernmodell zu trainieren, das menschliche Antikörper gegen das SARS-CoV-2-Spikesprotein mit hoher Genauigkeit von solchen gegen das Influenza-Hämagglutinin unterscheiden kann. Insgesamt liefert diese Studie eine wertvolle Ressource für die Antikörperforschung und vertieft unser molekulares Verständnis der öffentlichen Antikörperantworten.