Aufmerksame kreuzmodale Paratop-Vorhersage

Antikörper sind ein wesentlicher Bestandteil des Immunsystems und haben die Funktion, unerwünschte Objekte (die Antigene) direkt zu neutralisieren oder als Ziel für spätere Zerstörung zu markieren. Die Fähigkeit, vorherzusagen, welche Aminosäuren zum Paratop gehören – dem Bereich des Antikörpers, der sich an das Antigen bindet – kann die Antikörperdesign und den Fortschritt personalisierter Medizin fördern. Die Eignung tiefer neuronaler Netze für diese Aufgabe wurde kürzlich bestätigt, wobei Parapred alle früheren physikalischen Modelle übertrifft. Unser Beitrag ist zweigliedrig: Erstens verbessern wir die rechnerische Effizienz von Parapred erheblich durch die Nutzung von à trous-Konvolutionen und Selbst-Aufmerksamkeit. Zweitens implementieren wir multimodale Aufmerksamkeit, indem wir es den Antikörperresten ermöglichen, auf die Antigenreste aufzumerken. Dies führt zu neuen Stand der Technik-Ergebnissen in dieser Aufgabe sowie zu aufschlussreichen Interpretationen.