In Der TandemMod-Transferlernmodellforschung Verwendete Datensätze

Dieser Datensatz enthältTransferlernen ermöglicht die Identifizierung mehrerer Arten von RNA-Modifikationen mittels Nanoporen-Direkt-RNA-Sequenzierung„Die relevanten Datensätze, die in der Forschung verwendet wurden, jede Datei hat einen entsprechenden Code, der spezifische Inhalt ist wie folgt:

Der in dieser Studie verwendete veröffentlichte DRS-Datensatz stammt aus der Arbeit des Novoa-Labors am National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA, unter der Nummer GSE124309 , PRJNA563591 und die Arbeit von Intawat Nookaew, Nr. SRP166020 (In diesem Datensatz noch nicht verfügbar).

DRS-Daten für mehrere in dieser Studie verwendete menschliche Zelllinien sind öffentlich zugänglich beim Singapore Nanopore Expression Project und im European Nucleotide Archive (ENA) unter der Zugangsnummer PRJEB44348 (In diesem Datensatz noch nicht verfügbar). Reis ⁶ A-seq-Daten stammen aus der Gene Expression Omnibus (GEO) Datenbank, Nummer GSE135549 . Die m6ACE-Seq- und miCLIP-Daten der humanen HEK293T-Zelllinie sind in der GEO-Datenbank unter den Zugangsnummern verfügbar GSE124509 Und GSE63753 . MeRIP-seq der menschlichen Zelllinie K562 ist in der GEO-Datenbank unter der Zugangsnummer verfügbar GSE205709 . Vier In-vitro-Transkriptom-Datensätze (IVET), zwei IVT-Datensätze aus synthetischen Sequenzen und zwei Reis-Datensätze, die durch direkte RNA-Sequenzierung bei ONT generiert wurden, wurden in der GEO-Datenbank unter den Zugangsnummern hinterlegt GSE227087 .