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AI破解自然奥秘:揭示复杂蛋白质键的隐藏规律

科学家利用人工智能和分子模拟,揭开了自然界中一些最坚韧蛋白质键的隐藏机制。这类特殊蛋白键被称为“捕获键”(catch-bonds),其特性类似于中国式手指陷阱:施加拉力时反而越拉越紧。这种反直觉的行为在生物学中至关重要,例如帮助细菌黏附在人体细胞上、免疫细胞贴附血管壁,以及维持组织如软骨在持续机械应力下的稳定。 长期以来,一个核心科学疑问悬而未决:捕获键是否需要被拉伸到某一临界长度后才开始强化,还是在受力瞬间就立即激活?美国奥本大学物理系副教授拉斐尔·伯纳迪与科罗拉多州立大学前研究员马塞洛·梅洛团队通过结合大规模分子动力学模拟与人工智能技术,给出了答案。他们发现,捕获键几乎在受力的瞬间就“启动”了强化机制,无需等待拉伸至特定长度。 研究聚焦于一种名为细胞外多糖体(cellulosomes)的细菌蛋白复合物,这是自然界中最强的捕获键系统之一。研究人员通过“牵引分子动力学”模拟,逐原子地拉伸蛋白分子,生成了数百个高分辨率的动态“分子电影”。随后,他们训练AI回归模型,仅用模拟初期的短片段数据,就能准确预测蛋白键何时断裂。这一结果表明,蛋白在受力之初便已“决定”其抗拉强度,机制即刻激活。 “这说明捕获键的稳定性并非逐渐积累,而是在力作用的第一时间就建立起来。”伯纳迪表示。这一发现不仅深化了对生命如何利用机械力的理解,也为新材料和新疗法提供了灵感。例如,未来可设计出在受力时更牢固的生物粘合剂,或开发能响应机械刺激的智能药物递送系统。 该研究还凸显了AI在解析复杂生物动态过程中的强大能力。传统方法依赖静态结构分析,而AI能捕捉蛋白质界面在受力时的细微运动模式,识别出人类难以察觉的早期稳定信号。这为药物设计、生物材料工程和合成生物学开辟了新路径。 这项成果发表于《化学理论与计算杂志》(Journal of Chemical Theory and Computation),标志着物理、生物学与人工智能在交叉领域协同突破的典范。

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