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基于AlphaFold3接触建模实现精准DNA碱基编辑

近日,北京大学、华东师范大学及AI for Science Institute等机构研究团队发表突破性成果,成功开发基于AlphaFold3接触建模的基因组编辑新框架ContactSeek。该研究针对现有碱基编辑器脱靶率高的难题,创新性地结合AlphaFold3高分辨率结构预测与dI-profiling测序技术,通过量化目标与脱靶复合物间的接触概率变化,精准定位并优化关键氨基酸残基。实验表明,经ContactSeek优化的腺嘌呤与胞嘧啶碱基编辑器在维持高效靶向编辑的同时,脱靶率大幅降低超九成,显著提升编辑安全性与序列兼容性。相关结构预测与测序原始数据已全面公开至Zenodo及国家基因科学中心数据库。此项技术为基因治疗与合成生物学提供了高保真工具,有望加速精准基因编辑的临床转化进程。

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