一、教程简介

MAGE（Monoclonal Antibody Generator）是由美国范德堡大学医学中心（Vanderbilt University Medical Center, VUMC）的 IGlab（Immunogenomics Lab）团队于 2024 年 6 月发布的基于序列的蛋白质语言模型（PLM），该模型经过微调用于生成针对目标目标的配对人类变量重链和轻链抗体序列。可以证明 MAGE 能够生成具有实验验证的结合特异性的新颖多样抗体序列，针对 SARS-CoV-2 、一种新兴禽流感 H5N1 和呼吸道合胞病毒 A（RSV-A）。相关论文成果为「Generation of antigen-specific paired-chain antibodies using large language models」。

本教程采用资源为单卡 RTX 5090 。

二、项目示例

三、运行步骤

1. 启动容器后点击 API 地址即可进入 Web 界面

2. 使用步骤

若显示「Bad Gateway」，这表示模型正在初始化，由于模型较大，请等待约 2-3 分钟后刷新页面。

注意：

抗原提示应以氨基酸序列形式提供，去除任何信号肽或跨膜区域。

例如：SARS-CoV-2 指数株 RBD：RVQPTESIVRFPNITNLCPGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFFCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFPTNGVGYQPYRVLLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNF

四、交流探讨

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