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QEF_Benchmark 电子结构计算基准测试数据集
QEF_benchmark 是由 Quantum ESPRESSO Foundation (QEF) 官方维护的一套高性能计算(HPC)性能验证与测试输入集合,用于评估第一性原理电子结构软件 Quantum ESPRESSO 在不同硬件平台(CPU / GPU / 向量引擎)及并行策略(MPI/OpenMP/Hybrid)下的计算性能、扩展性与能效表现。
该数据集基于 Quantum ESPRESSO 的核心模块(如 pw.x 、 ph.x 等),设计涵盖从小分子到大规模金属表面体系的多种典型计算场景。它为 HPC 环境提供了标准化的测试任务,是验证计算节点性能、编译器优化和并行效率的事实标准。
数据集结构
数据集位于官方 GitHub 仓库的 benchmarks/ 目录下,整体目录结构如下:
bash
benchmarks/
├── AUSURF112/ # Au (111) 表面 112 原子基准(中型 DFT 测试)
├── ALCHEMI/ # 电子态投影 ALCHEMI 分析基准
├── C60/ # 富勒烯体系(C60 分子)基准
├── GRAPHENE/ # 石墨烯平面结构基准
├── H2O-256/ # 256 个水分子体系(MD/SCF 性能测试)
├── Si256/ # 硅超胞体系(并行扩展性基准)
├── Si512/ # 更大规模硅体系,用于强扩展测试
├── NITROGEN/ # 氮分子能带与电子密度基准
├── WATER_MOLECULE/ # 小体系 DFT 验证(入门与功能测试)
├── README.md # 官方基准使用说明
每个子目录均包含:
- 输入文件 (.in):Quantum ESPRESSO 模块的主控制文件;
- 伪势文件 (.UPF):体系所需赝势;
- 参考输出 (.out):标准结果对照;
- 脚本文件 (.sh):示例并行运行脚本(如 Slurm 或 MPI 环境)。
数据集内容
- AUSURF112:DFT (SCF),金表面 Au(111) 含 112 原子,用于测试中型体系的 FFT 性能与并行通信效率。
- CNT10POR8:DFT (Relax),(10,8) 碳纳米管体系,用于大体系下的 SCF 收敛与内存占用评估。
- GRIR443 / GRIR686:DFT (SCF),石墨烯/铱 (111) 界面体系(443 与 686 原子),用于评估多节点并行与 FFT 通信性能。
- PHONON:DFPT (ph.x),多晶硅、石英、 LaO 、 CrI₃ 等体系,用于测试声子计算与线性响应模块性能。
- PSIWAT:Hybrid DFT(EXX),水分子体系,用于评估混合泛函计算下的通信与内存性能。
- other-inputs:附加体系(如 CuO 、 H₂O),用于功能性验证与测试输入参考。
- small-benchmarks:DFT / Relax,小型多元素体系(如 Si 、 C 、 Fe 、 H₂O 等),包含自动化运行脚本与伪势文件,用于快速性能回归、单节点效率评估与编译优化测试。