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QEF_Benchmark 电子结构计算基准测试数据集

日期

2 天前

发布地址

github.com

许可协议

MIT

QEF_benchmark 是由 Quantum ESPRESSO Foundation (QEF) 官方维护的一套高性能计算(HPC)性能验证与测试输入集合,用于评估第一性原理电子结构软件 Quantum ESPRESSO 在不同硬件平台(CPU / GPU / 向量引擎)及并行策略(MPI/OpenMP/Hybrid)下的计算性能、扩展性与能效表现。

该数据集基于 Quantum ESPRESSO 的核心模块(如 pw.x 、 ph.x 等),设计涵盖从小分子到大规模金属表面体系的多种典型计算场景。它为 HPC 环境提供了标准化的测试任务,是验证计算节点性能、编译器优化和并行效率的事实标准。


数据集结构

数据集位于官方 GitHub 仓库的 benchmarks/ 目录下,整体目录结构如下:

  bash
benchmarks/
 ├── AUSURF112/        # Au (111) 表面 112 原子基准(中型 DFT 测试)
 ├── ALCHEMI/          # 电子态投影 ALCHEMI 分析基准
 ├── C60/              # 富勒烯体系(C60 分子)基准
 ├── GRAPHENE/         # 石墨烯平面结构基准
 ├── H2O-256/          # 256 个水分子体系(MD/SCF 性能测试)
 ├── Si256/            # 硅超胞体系(并行扩展性基准)
 ├── Si512/            # 更大规模硅体系,用于强扩展测试
 ├── NITROGEN/         # 氮分子能带与电子密度基准
 ├── WATER_MOLECULE/   # 小体系 DFT 验证(入门与功能测试)
 ├── README.md         # 官方基准使用说明

每个子目录均包含:

  • 输入文件 (.in):Quantum ESPRESSO 模块的主控制文件;
  • 伪势文件 (.UPF):体系所需赝势;
  • 参考输出 (.out):标准结果对照;
  • 脚本文件 (.sh):示例并行运行脚本(如 Slurm 或 MPI 环境)。

数据集内容

  • AUSURF112:DFT (SCF),金表面 Au(111) 含 112 原子,用于测试中型体系的 FFT 性能与并行通信效率。
  • CNT10POR8:DFT (Relax),(10,8) 碳纳米管体系,用于大体系下的 SCF 收敛与内存占用评估。
  • GRIR443 / GRIR686:DFT (SCF),石墨烯/铱 (111) 界面体系(443 与 686 原子),用于评估多节点并行与 FFT 通信性能。
  • PHONON:DFPT (ph.x),多晶硅、石英、 LaO 、 CrI₃ 等体系,用于测试声子计算与线性响应模块性能。
  • PSIWAT:Hybrid DFT(EXX),水分子体系,用于评估混合泛函计算下的通信与内存性能。
  • other-inputs:附加体系(如 CuO 、 H₂O),用于功能性验证与测试输入参考。
  • small-benchmarks:DFT / Relax,小型多元素体系(如 Si 、 C 、 Fe 、 H₂O 等),包含自动化运行脚本与伪势文件,用于快速性能回归、单节点效率评估与编译优化测试。

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